fullseye

morph_tophat3d — 3D morphology op

• データ種: voxel → voxel
• 呼び出し: import fullseye as fs; fs.ledger.morph_tophat3d(vol, r=1, device='cpu', se='cube') (実装を直接呼ぶなら import match3d; match3d.morph_tophat3d(vol, r=1, device='cpu', se='cube')、台帳から引くなら ops3d.get("morph_tophat3d"))
• GPU: この op は GPU 経路あり(device="cuda")

使い方

3D white top-hat = vol − opening。SE より小さい 明構造を抽出(keypoint 前処理)。

vol(float32) − morph_open3d(vol, r, ...)。値は 0 以上で、SE(一辺 2r+1 の cube か 半径 r の ball)に入り切らない明るい突起・粒・細線だけがその高さで残り、それより大きな 明領域と滑らかな背景は 0 になる。背景の緩い明るさムラも除けるので、閾値化の前処理に。 r は「残したい構造の半径」より大きく取る。se は “cube”/”ball”(他は ValueError)、 device は cube+torch のときだけ有効。返り値 (D,H,W) float32 numpy。 暗い構造を取るなら morph_blackhat3d。

参考(サンプルデータ・文献)

• サンプルデータ カタログ(DL URL / ライセンス) — 2-D は skimage.data(BSD/public)+ 合成、3-D は実データ源(Stanford/PDS 等)の DL URL。
• 演算子の来歴・参考文献 — この op 族の元になった研究/手法の出典。

実行できる例(この op を実際に呼ぶ検証済みサンプル)

• diff_features — py -3.11 examples_3d/diff_features.py
• morphology_3d — py -3.11 examples_3d/morphology_3d.py

型が繋がる次の op(voxel を入力に取れる)

voxel_to_mips · voxel_to_mesh · signed_distance_field · to_points · sobel3d · hessian3d · curvature_maps · edt_jfa

同カテゴリ(morphology)

morph_dilate3d · morph_erode3d · morph_open3d · morph_close3d · morph_gradient3d · morph_blackhat3d

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Provenance: match3d.py — 3D operator registry. この per-op ノートは tools/opdocs.py md が自動生成(手編集しない)。

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