fullseye

vol_region_props — 3D `regionprops` op

データ種: labels → table
呼び出し: import fullseye as fs; fs.ledger.vol_region_props(labels, spacing=None, surface='auto') (実装を直接呼ぶなら import volops; volops.vol_region_props(labels, spacing=None, surface='auto')、台帳から引くなら ops3d.get("vol_region_props"))

使い方

Per-component quantitative descriptors from a label volume.

labels is the int volume returned by :func:vol_label (or any integer labelling; voxels <= 0 are background). Pass spacing (sz, sy, sx) (or a :class:volio.VolumeMeta) to report physical volume in mm3 and physical surface area in mm2. surface selects the surface-area estimator: "auto" (marching cubes when scikit-image is importable, else exposed faces), "marching" (require marching cubes), or "faces" (always the face count).

Returns a list[dict] (one per label 1..n, in ascending label order), each with:

label id · voxel_count · volume (voxels, or mm3 with spacing) · centroid (z, y, x) in voxel-index coordinates · bbox (z0, z1, y0, y1, x0, x1) with **exclusive upper bounds (slice stop) · surface_area (voxel-face units, or mm**2 with spacing) · sphericity (Wadell, ~1 for a sphere, lower for a slab; approximate — see module note).

背景知識ガイド(この op の手前にある物理・規約)

measurement_uncertainty — 計測の不確かさと校正の知識 — 「測れている」を主張するために

参考(サンプルデータ・文献)

サンプルデータカタログ(DL URL / ライセンス) — 2-D は skimage.data(BSD/public)+ 合成、3-D は実データ源(Stanford/PDS 等)の DL URL。
演算子の来歴・参考文献 — この op 族の元になった研究/手法の出典。

実行できる例(この op を実際に呼ぶ検証済みサンプル)

vessel_metrology — py -3.11 examples_3d/vessel_metrology.py

型が繋がる次の op(`table` を入力に取れる)

fuse_to_voxel · mesh_select_lod

同カテゴリ(`regionprops`)

label_components · region_props · largest_component · filter_by_volume · inner_box3 · vol_label

Provenance: volops.py — 3D operator registry. この per-op ノートは tools/opdocs.py md が自動生成(手編集しない)。

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