fullseye

shape_mean — SHAPESTAT procrustes op

• データ種: shapeset → points
• 呼び出し: import fullseye as fs; fs.ledger.shape_mean(shapes, max_iter: 'int' = 100, tol: 'float' = 1e-10, scaling: 'bool' = True, reflection: 'bool' = False) (実装を直接呼ぶなら import shapestats; shapestats.shape_mean(shapes, max_iter: 'int' = 100, tol: 'float' = 1e-10, scaling: 'bool' = True, reflection: 'bool' = False)、台帳から引くなら opsshapestat.get("shape_mean"))

使い方

GPA で揃えたあとの平均形状。→ (N, 3)。

★ 生の平均(shapes.mean(0))と混同しないこと。位置と向きを揃えずに 平均すると、個体がばらばらに置かれているぶんだけ形が縮む。合わせてから 平均するのが「平均形状」。

詳しい使い方ガイド

• shape_statistics ファミリ ガイド

参考(サンプルデータ・文献)

• サンプルデータ カタログ(DL URL / ライセンス) — 2-D は skimage.data(BSD/public)+ 合成、3-D は実データ源(Stanford/PDS 等)の DL URL。
• 演算子の来歴・参考文献 — この op 族の元になった研究/手法の出典。
• アルゴリズムの正典(著者・年)と用途は上記ファミリ使い方ガイドに記載。

実行できる例(この op を実際に呼ぶ検証済みサンプル)

• shapestat_landmark_tour — py -3.11 examples/shapestat_landmark_tour.py

型が繋がる次の op(points を入力に取れる)

shape_perturb · procrustes_fit · procrustes_align · procrustes_distance · shape_project · shape_mahalanobis · mirror_plane_from_pairs · landmark_asymmetry

同カテゴリ(procrustes)

procrustes_fit · procrustes_align · procrustes_distance · generalized_procrustes

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Provenance: shapestats.py — SHAPESTAT operator registry. この per-op ノートは tools/opdocs.py md が自動生成(手編集しない)。

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