fullseye

generalized_procrustes — SHAPESTAT procrustes op

• データ種: shapeset → shapeset
• 呼び出し: import fullseye as fs; fs.ledger.generalized_procrustes(shapes, max_iter: 'int' = 100, tol: 'float' = 1e-10, scaling: 'bool' = True, reflection: 'bool' = False) (実装を直接呼ぶなら import shapestats; shapestats.generalized_procrustes(shapes, max_iter: 'int' = 100, tol: 'float' = 1e-10, scaling: 'bool' = True, reflection: 'bool' = False)、台帳から引くなら opsshapestat.get("generalized_procrustes"))

使い方

一般化 Procrustes(GPA)。全個体を共通の枠へ。→ (K, N, 3)。

手順は教科書どおり: 1 個体を仮の平均にして全員を合わせ、平均を取り直し、 その平均を最初の個体に合わせ直して枠の漂流を止め、収束まで繰り返す。 最後の一手が無いと平均が毎回ゆっくり回り、tol に到達しない。

収束の判定は平均形状の移動量(点ごと RMS)。反復数と収束の可否は :func:shape_mean ではなくこちらには返らない —— 群を返す関数なので、 診断が要るときは前後で :func:procrustes_distance を測ること。

詳しい使い方ガイド

• shape_statistics ファミリ ガイド

参考(サンプルデータ・文献)

• サンプルデータ カタログ(DL URL / ライセンス) — 2-D は skimage.data(BSD/public)+ 合成、3-D は実データ源(Stanford/PDS 等)の DL URL。
• 演算子の来歴・参考文献 — この op 族の元になった研究/手法の出典。
• アルゴリズムの正典(著者・年)と用途は上記ファミリ使い方ガイドに記載。

実行できる例(この op を実際に呼ぶ検証済みサンプル)

• shapestat_landmark_tour — py -3.11 examples/shapestat_landmark_tour.py

型が繋がる次の op(shapeset を入力に取れる)

shape_mean · shape_pca

同カテゴリ(procrustes)

procrustes_fit · procrustes_align · procrustes_distance · shape_mean

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Provenance: shapestats.py — SHAPESTAT operator registry. この per-op ノートは tools/opdocs.py md が自動生成(手編集しない)。

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