fullseye

vol_rle_volume — 3D rle_region op

• データ種: rle_region → measurement
• 呼び出し: import fullseye as fs; fs.ledger.vol_rle_volume(region) -> 'int' (実装を直接呼ぶなら import volregion; volregion.vol_rle_volume(region) -> 'int'、台帳から引くなら ops3d.get("vol_rle_volume"))

使い方

Voxel count of the region, computed on the runs (no decode). Measured

~300x faster than summing the dense mask.

計算: sum(ends - starts)(差は int64 で取るので run 数が多くても溢れない)。 返り値は Python の int(voxel 個数、単位は voxel。物理体積 mm^3 が欲しければ spacing の積 sz*sy*sx を自分で掛ける — この op は spacing を受けない)。

入力は _require_rle で検証してから使う(VolRLE 以外、shape・run 配列の 不整合、範囲外の run は ValueError)。空の region は 0 を返す(エラーに しない)。vol_rle_decode してから sum() するのと同じ値を、密配列を作らずに 返すのが目的。vol_rle_components の各成分にかければ成分ごとの体積になる。

参考(サンプルデータ・文献)

• サンプルデータ カタログ(DL URL / ライセンス) — 2-D は skimage.data(BSD/public)+ 合成、3-D は実データ源(Stanford/PDS 等)の DL URL。
• 演算子の来歴・参考文献 — この op 族の元になった研究/手法の出典。

実行できる例(この op を実際に呼ぶ検証済みサンプル)

• rle_region_efficiency — py -3.11 examples_3d/rle_region_efficiency.py

型が繋がる次の op(measurement を入力に取れる)

vol_gaussian_psf · fuse_to_voxel · fresnel_reflectance · snell_angle

同カテゴリ(rle_region)

vol_rle_encode · vol_rle_decode · vol_rle_bbox · vol_rle_centroid · vol_rle_union · vol_rle_intersect · vol_rle_difference · vol_rle_components

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Provenance: volregion.py — 3D operator registry. この per-op ノートは tools/opdocs.py md が自動生成(手編集しない)。

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