fullseye

vol_rle_encode — 3D rle_region op

• データ種: voxel → rle_region
• 呼び出し: import fullseye as fs; fs.ledger.vol_rle_encode(vol_binary) -> 'VolRLE' (実装を直接呼ぶなら import volregion; volregion.vol_rle_encode(vol_binary) -> 'VolRLE'、台帳から引くなら ops3d.get("vol_rle_encode"))

使い方

Encode a binary volume as x-runs (the 3-D HALCON-region representation).

A non-{0, 1} input is thresholded at > 0.5 (the :mod:volops convention). NaN / Inf are rejected. An empty mask encodes to zero runs — a valid region that decodes back to all-background.

Memory: proportional to the number of runs (~surface complexity per plane row), not to the voxel count — measured 1/145 of the dense bool mask on a realistic 384**3 part.

何を作るか: (D, H, W) のバイナリ volume を、x 軸(最終軸)方向の連続前景区間 (run)の列に変換する。VolRLE は rows(平面行 id z*H + y、int32、昇順)、 starts / ends(run の x 範囲 [start, end)、end は排他的)、shape (元の (D, H, W))を持つ frozen dataclass。run i は vol[z, y, starts[i]:ends[i]] を表す。

引数と検証(fail-closed):

• vol_binary: 3-D 配列。bool ならそのまま、それ以外は float64 に変換して NaN/Inf があれば ValueError、> 0.5 で二値化する。
• 3-D でない、または voxel 数が MAX_VOXELS(1 << 27 ≈ 1.34 億)を超えると ValueError。
• 空マスクは run 数 0 の VolRLE になる(エラーではない)。

注意: 軸順は [z, y, x](depth, row, col)。run は x 方向にしか走らないので、 x 方向に細かく途切れる形状(縞・ノイズ)ほど run 数が増え、圧縮の利点は減る。 vol_rle_volume / vol_rle_bbox / vol_rle_centroid は decode せずに run 上で答える。集合演算は vol_rle_union / vol_rle_intersect / vol_rle_difference、密配列へ戻すのは vol_rle_decode。

参考(サンプルデータ・文献)

• サンプルデータ カタログ(DL URL / ライセンス) — 2-D は skimage.data(BSD/public)+ 合成、3-D は実データ源(Stanford/PDS 等)の DL URL。
• 演算子の来歴・参考文献 — この op 族の元になった研究/手法の出典。

実行できる例(この op を実際に呼ぶ検証済みサンプル)

• rle_region_efficiency — py -3.11 examples_3d/rle_region_efficiency.py

型が繋がる次の op(rle_region を入力に取れる)

vol_rle_decode · vol_rle_volume · vol_rle_bbox · vol_rle_centroid · vol_rle_union · vol_rle_intersect · vol_rle_difference · fuse_to_voxel

同カテゴリ(rle_region)

vol_rle_decode · vol_rle_volume · vol_rle_bbox · vol_rle_centroid · vol_rle_union · vol_rle_intersect · vol_rle_difference · vol_rle_components

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Provenance: volregion.py — 3D operator registry. この per-op ノートは tools/opdocs.py md が自動生成(手編集しない)。

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