fullseye

watershed_vol — SEGMENTATION `watershed3d` op

データ種: voxel → labels
呼び出し: import fullseye as fs; fs.ledger.watershed_vol(binary, markers: 'Optional[np.ndarray]' = None, min_distance: 'float' = 1.0, method: 'str' = 'auto') -> 'np.ndarray' (実装を直接呼ぶなら import watershed3d; watershed3d.watershed_vol(binary, markers: 'Optional[np.ndarray]' = None, min_distance: 'float' = 1.0, method: 'str' = 'auto') -> 'np.ndarray'、台帳から引くなら opssegmentation.get("watershed_vol"))

使い方

距離変換シードの分水嶺で 3D 前景を物体ごとのラベルに分割する(公開 op の薄い合成)。

連結成分では 1 個に融合する接触/僅かな重なりを割るのが目的。EDT は :func:volops.vol_distance_transform、skimage 分水嶺は :func:volops.vol_watershed に委譲し、本モジュールは (A) skimage 不在時の純 scipy フォールバックと、シード自動生成のグルーだけを足す。markers を省略すると距離変換の局所極大(min_distance NMS)を自動シードにする。

Parameters

binary : array_like bool または 0/1 の 3D 前景ボリューム。 markers : ndarray or None シードを外部指定する場合の int ラベル配列(binary と同形状、0=無し, 1..n=シード)。 None なら距離変換の極大から自動生成する。 min_distance : float markers=None のときのシード最小間隔(voxel)。 method : {“auto”, “skimage”, “scipy”} バックエンド選択。”skimage” 指定で不在なら fail-closed(ImportError)。

Returns

labels : ndarray(int32) binary と同形状。背景 0、各物体に 1..k のラベル(前景を過不足なく被覆)。

Raises

ValueError 形状不正・退化入力・不正 method のとき(fail-closed)。

空の入力(binary が 0 要素)は ValueError。

詳しい使い方ガイド

halcon_segmentation ファミリガイド

参考(サンプルデータ・文献)

サンプルデータカタログ(DL URL / ライセンス) — 2-D は skimage.data(BSD/public)+ 合成、3-D は実データ源(Stanford/PDS 等)の DL URL。
演算子の来歴・参考文献 — この op 族の元になった研究/手法の出典。
アルゴリズムの正典(著者・年)と用途は上記ファミリ使い方ガイドに記載。

実行できる例(この op を実際に呼ぶ検証済みサンプル)

watershed3d_tour — py -3.11 examples/watershed3d_tour.py

型が繋がる次の op(`labels` を入力に取れる)

—

同カテゴリ(`watershed3d`)

distance_peaks · separate_touching

Provenance: watershed3d.py — SEGMENTATION operator registry. この per-op ノートは tools/opdocs.py md が自動生成(手編集しない)。

This site is open source. Improve this page.