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separate_touching — SEGMENTATION watershed3d op

使い方

genuinely-new (B): 接触物体を 1 呼び出しで自動分離する常用ラッパ。

「複数物体が接触して 1 連結成分に融合している」典型ケースを、距離変換→極大 NMS シード化→ 分水嶺という定型パイプラインを畳んで 1 コールで割る(公開 API では 3 op を手で繋ぐ必要が あるところを常用ケース向けに 1 関数化)。中身は watershed_vol(..., markers=None)。

Parameters

binary : array_like bool または 0/1 の 3D 前景ボリューム。 min_distance : float 分離シードの最小間隔(voxel)。想定物体半径程度が目安。 method : {“auto”, “skimage”, “scipy”} バックエンド選択。

Returns

labels : ndarray(int32) binary と同形状。背景 0、分離された各物体に 1..k のラベル。

空の入力(binary が 0 要素)は ValueError。

詳しい使い方ガイド

参考(サンプルデータ・文献)

実行できる例(この op を実際に呼ぶ検証済みサンプル)

型が繋がる次の op(labels を入力に取れる)

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同カテゴリ(watershed3d)

distance_peaks · watershed_vol


Provenance: watershed3d.py — SEGMENTATION operator registry. この per-op ノートは tools/opdocs.py md が自動生成(手編集しない)。

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