fullseye

vol_watershed — 3D segment op

• データ種: voxel → labels
• 呼び出し: import fullseye as fs; fs.ledger.vol_watershed(vol, markers, mask=None) (実装を直接呼ぶなら import volops; volops.vol_watershed(vol, markers, mask=None)、台帳から引くなら ops3d.get("vol_watershed"))

使い方

Marker-controlled 3-D watershed segmentation (optional — scikit-image).

Floods the volume from the labelled markers (an int volume, 0 = unset), optionally restricted to mask. Delegates to skimage.segmentation.watershed — treat vol as a landscape (e.g. a gradient magnitude, or the negated distance transform for splitting touching blobs). Returns an int32 (D, H, W) label volume.

Raises ImportError with a clear pip install scikit-image message when the optional dependency is absent; the rest of this module needs only numpy + scipy.

参考(サンプルデータ・文献)

• サンプルデータ カタログ(DL URL / ライセンス) — 2-D は skimage.data(BSD/public)+ 合成、3-D は実データ源(Stanford/PDS 等)の DL URL。
• 演算子の来歴・参考文献 — この op 族の元になった研究/手法の出典。

実行できる例(この op を実際に呼ぶ検証済みサンプル)

• molecule_atom_count — py -3.11 examples_3d/molecule_atom_count.py

型が繋がる次の op(labels を入力に取れる)

fuse_to_voxel · vol_region_props

同カテゴリ(segment)

region_growing · euclidean_cluster · plane_segmentation

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Provenance: volops.py — 3D operator registry. この per-op ノートは tools/opdocs.py md が自動生成(手編集しない)。

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