fullseye

vol_colorize_labels — VOLCOLOR colorize op

• データ種: labels → rgbvolume
• 呼び出し: import fullseye as fs; fs.ledger.vol_colorize_labels(labels, seed: 'int' = 0, background=(0.0, 0.0, 0.0)) (実装を直接呼ぶなら import volcolor; volcolor.vol_colorize_labels(labels, seed: 'int' = 0, background=(0.0, 0.0, 0.0))、台帳から引くなら opsvolcolor.get("vol_colorize_labels"))

使い方

3-D ラベルボリューム -> (D, H, W, 3) float64 の RGB ボリューム。

「切ってから色を付ける」のではなく「色を付けてから切る」ための入口。 ラベル k の色は :func:vol_label_palette の行 k そのもので、 imgio.colorize_labels(labels, seed) を同じ配列に対して呼んだ結果と バイト単位で一致する(tests/test_volcolor.py が固定)。

切る順序が効くこと自体は :func:vol_label_color_flicker が数える。実測 (16 球・(24, 48, 48) の参照ファントム、connectivity=26、seed=0): スライスごとに色を付け直すと 24 スライス中 20 スライスで少なくとも 1 成分の色が変わり、(成分, スライス) の変化は 108 組中 62 件、 16 成分すべてが一度は色を変える。ボリュームで色を付けてから切ると 3 つとも 0。

Raises ValueError on a non-3-D, float, or negative label volume, on a label over :data:MAX_LABELS, or on more than :data:MAX_COLOR_VOXELS voxels.

参考(サンプルデータ・文献)

• サンプルデータ カタログ(DL URL / ライセンス) — 2-D は skimage.data(BSD/public)+ 合成、3-D は実データ源(Stanford/PDS 等)の DL URL。
• 演算子の来歴・参考文献 — この op 族の元になった研究/手法の出典。
• アルゴリズムの正典(著者・年)と用途は上記ファミリ使い方ガイドに記載。

実行できる例(この op を実際に呼ぶ検証済みサンプル)

• voxel_labels_color — py -3.11 examples/voxel_labels_color.py

型が繋がる次の op(rgbvolume を入力に取れる)

vol_label_slice_rgb · vol_label_mpr_rgb

同カテゴリ(colorize)

vol_label_overlay

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Provenance: volcolor.py — VOLCOLOR operator registry. この per-op ノートは tools/opdocs.py md が自動生成(手編集しない)。

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