fullseye

blob_distance — BLOB split op

• データ種: mask → image2d
• 呼び出し: import fullseye as fs; fs.ledger.blob_distance(region: 'Any', spacing: 'float' = 1.0) -> 'np.ndarray' (実装を直接呼ぶなら import blob2d; blob2d.blob_distance(region: 'Any', spacing: 'float' = 1.0) -> 'np.ndarray'、台帳から引くなら opsblob.get("blob_distance"))

使い方

前景の各画素からいちばん近い背景までの距離。単位は spacing 倍。

scipy.ndimage.distance_transform_edt そのもの。わざわざ口を作った 理由は、進化 op の distance_transform が最大値で正規化して返すため (poc_cell_counting の実測: 出力の最大が常に 1.0)、画素単位の距離が 取れないこと。分水嶺の種を作るには絶対値が要る。

Examples

import numpy as np m = np.zeros((21, 21), bool); m[5:16, 5:16] = True float(blob_distance(m).max()) # 11x11 の正方形の中心まで 6.0

詳しい使い方ガイド

• blob_analysis ファミリ ガイド

参考(サンプルデータ・文献)

• サンプルデータ カタログ(DL URL / ライセンス) — 2-D は skimage.data(BSD/public)+ 合成、3-D は実データ源(Stanford/PDS 等)の DL URL。
• 演算子の来歴・参考文献 — この op 族の元になった研究/手法の出典。
• アルゴリズムの正典(著者・年)と用途は上記ファミリ使い方ガイドに記載。

実行できる例(この op を実際に呼ぶ検証済みサンプル)

• blob_split_tour — py -3.11 examples/blob_split_tour.py
• poc_bone_trabecular_thickness — py -3.11 examples/poc_bone_trabecular_thickness.py

型が繋がる次の op(image2d を入力に取れる)

blob_seeds · blob_split · blob_overlay

同カテゴリ(split)

blob_seeds · blob_split

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Provenance: blob2d.py — BLOB operator registry. この per-op ノートは tools/opdocs.py md が自動生成(手編集しない)。

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